Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VGFO15240 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VGFO15240 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VGFO15240 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VGFO15240 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VGFO15240 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VGFO15240 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VGFO15240 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VGFO15240 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VGFO15240 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VGFO15240 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
VGFO15240 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
VGFO15240 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
VGFO15240 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VGFO15240 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VGFO15240 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VGFO15240 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VGFO15240 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VGFO15240 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VGFO15240 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VGFO15240 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VGFO15240 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VGFO15240 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
VGFO15240 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VGFO15240 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
VGFO15240 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VGFO15240 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VGFO15240 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VGFO15240 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
VGFO15240 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
VGFO15240 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
VGFO15240 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
VGFO15240 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
VGFO15240 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
VGFO15240 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
VGFO15240 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
VGFO15240 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
VGFO15240 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
VGFO15240 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
VGFO15240 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VGFO15240 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
VGFO15240 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VGFO15240 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VGFO15240 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VGFO15240 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VGFO15240 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VGFO15240 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VGFO15240 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VGFO15240 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VGFO15240 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VGFO15240 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VGFO15240 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VGFO15240 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VGFO15240 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VGFO15240 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VGFO15240 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VGFO15240 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VGFO15240 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VGFO15240 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VGFO15240 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VGFO15240 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VGFO15240 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VGFO15240 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VGFO15240 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VGFO15240 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VGFO15240 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VGFO15240 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VGFO15240 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VGFO15240 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VGFO15240 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
VGFO15240 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VGFO15240 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VGFO15240 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
VGFO15240 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VGFO15240 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VGFO15240 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VGFO15240 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VGFO15240 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VGFO15240 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VGFO15240 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VGFO15240 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VGFO15240 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VGFO15240 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
VGFO15240 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
VGFO15240 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VGFO15240 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VGFO15240 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VGFO15240 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VGFO15240 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VGFO15240 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VGFO15240 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VGFO15240 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VGFO15240 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VGFO15240 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VGFO15240 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VGFO15240 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VGFO15240 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VGFO15240 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VGFO15240 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VGFO15240 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
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