Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYNMO15061 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYNMO15061 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYNMO15061 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYNMO15061 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYNMO15061 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYNMO15061 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYNMO15061 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYNMO15061 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYNMO15061 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SYNMO15061 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYNMO15061 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYNMO15061 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYNMO15061 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SYNMO15061 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYNMO15061 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYNMO15061 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SYNMO15061 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SYNMO15061 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYNMO15061 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYNMO15061 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SYNMO15061 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYNMO15061 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYNMO15061 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNMO15061 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNMO15061 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNMO15061 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNMO15061 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNMO15061 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNMO15061 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNMO15061 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNMO15061 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNMO15061 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNMO15061 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNMO15061 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNMO15061 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNMO15061 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNMO15061 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYNMO15061 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYNMO15061 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYNMO15061 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYNMO15061 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SYNMO15061 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SYNMO15061 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYNMO15061 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYNMO15061 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYNMO15061 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYNMO15061 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYNMO15061 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYNMO15061 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYNMO15061 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
SYNMO15061 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SYNMO15061 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SYNMO15061 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SYNMO15061 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYNMO15061 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYNMO15061 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SYNMO15061 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYNMO15061 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SYNMO15061 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYNMO15061 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYNMO15061 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYNMO15061 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYNMO15061 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SYNMO15061 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYNMO15061 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYNMO15061 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYNMO15061 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYNMO15061 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYNMO15061 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYNMO15061 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYNMO15061 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYNMO15061 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYNMO15061 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYNMO15061 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYNMO15061 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYNMO15061 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYNMO15061 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYNMO15061 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYNMO15061 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYNMO15061 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYNMO15061 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYNMO15061 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYNMO15061 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SYNMO15061 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYNMO15061 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYNMO15061 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYNMO15061 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYNMO15061 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYNMO15061 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYNMO15061 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYNMO15061 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYNMO15061 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYNMO15061 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYNMO15061 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYNMO15061 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SYNMO15061 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYNMO15061 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYNMO15061 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYNMO15061 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms