Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms