Protein–RNA interactions for Protein: A6PVI3

NCBP2L, Nuclear cap-binding protein subunit 2-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP2LA6PVI3 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms