Protein–RNA interactions for Protein: A6NIX2

WTIP, Wilms tumor protein 1-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WTIPA6NIX2 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WTIPA6NIX2 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
WTIPA6NIX2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WTIPA6NIX2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WTIPA6NIX2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WTIPA6NIX2 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WTIPA6NIX2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WTIPA6NIX2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WTIPA6NIX2 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WTIPA6NIX2 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WTIPA6NIX2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WTIPA6NIX2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WTIPA6NIX2 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
WTIPA6NIX2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
WTIPA6NIX2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WTIPA6NIX2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WTIPA6NIX2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
WTIPA6NIX2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WTIPA6NIX2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WTIPA6NIX2 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
WTIPA6NIX2 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WTIPA6NIX2 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
WTIPA6NIX2 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
WTIPA6NIX2 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
WTIPA6NIX2 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
WTIPA6NIX2 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
WTIPA6NIX2 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
WTIPA6NIX2 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
WTIPA6NIX2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WTIPA6NIX2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WTIPA6NIX2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WTIPA6NIX2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WTIPA6NIX2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WTIPA6NIX2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WTIPA6NIX2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
WTIPA6NIX2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
WTIPA6NIX2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WTIPA6NIX2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WTIPA6NIX2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WTIPA6NIX2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WTIPA6NIX2 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WTIPA6NIX2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WTIPA6NIX2 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
WTIPA6NIX2 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WTIPA6NIX2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WTIPA6NIX2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
WTIPA6NIX2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WTIPA6NIX2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WTIPA6NIX2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WTIPA6NIX2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WTIPA6NIX2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WTIPA6NIX2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WTIPA6NIX2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WTIPA6NIX2 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WTIPA6NIX2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WTIPA6NIX2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WTIPA6NIX2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WTIPA6NIX2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WTIPA6NIX2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
WTIPA6NIX2 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WTIPA6NIX2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WTIPA6NIX2 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
WTIPA6NIX2 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WTIPA6NIX2 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WTIPA6NIX2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WTIPA6NIX2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WTIPA6NIX2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WTIPA6NIX2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WTIPA6NIX2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
WTIPA6NIX2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WTIPA6NIX2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WTIPA6NIX2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WTIPA6NIX2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WTIPA6NIX2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WTIPA6NIX2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WTIPA6NIX2 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WTIPA6NIX2 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WTIPA6NIX2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WTIPA6NIX2 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WTIPA6NIX2 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WTIPA6NIX2 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
WTIPA6NIX2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WTIPA6NIX2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WTIPA6NIX2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
WTIPA6NIX2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WTIPA6NIX2 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WTIPA6NIX2 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WTIPA6NIX2 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WTIPA6NIX2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WTIPA6NIX2 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WTIPA6NIX2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WTIPA6NIX2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WTIPA6NIX2 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WTIPA6NIX2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WTIPA6NIX2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WTIPA6NIX2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WTIPA6NIX2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WTIPA6NIX2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WTIPA6NIX2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WTIPA6NIX2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms