Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC160A6NGH7 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms