Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NEMP2A6NFY4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEMP2A6NFY4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEMP2A6NFY4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEMP2A6NFY4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEMP2A6NFY4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEMP2A6NFY4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEMP2A6NFY4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEMP2A6NFY4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
NEMP2A6NFY4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEMP2A6NFY4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEMP2A6NFY4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEMP2A6NFY4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEMP2A6NFY4 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEMP2A6NFY4 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEMP2A6NFY4 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEMP2A6NFY4 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEMP2A6NFY4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEMP2A6NFY4 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEMP2A6NFY4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEMP2A6NFY4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEMP2A6NFY4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEMP2A6NFY4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NEMP2A6NFY4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms