Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GOLGA6L4A6NEF3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6L4A6NEF3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms