Protein–RNA interactions for Protein: A6NE82

MBD3L3, Putative methyl-CpG-binding domain protein 3-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L3A6NE82 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD3L3A6NE82 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD3L3A6NE82 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms