Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GJA3Q9Y6H8 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA3Q9Y6H8 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms