Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
ARFGEF2Q9Y6D5 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARFGEF2Q9Y6D5 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms