Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SH3BP1Q9Y3L3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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SH3BP1Q9Y3L3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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SH3BP1Q9Y3L3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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SH3BP1Q9Y3L3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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SH3BP1Q9Y3L3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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SH3BP1Q9Y3L3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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SH3BP1Q9Y3L3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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SH3BP1Q9Y3L3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
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SH3BP1Q9Y3L3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SH3BP1Q9Y3L3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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