Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
THRAP3Q9Y2W1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms