Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 HNRNPA1P23-201ENST00000491091 1133 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATF5Q9Y2D1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 AL034417.3-201ENST00000641100 1043 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF5Q9Y2D1 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms