Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC4Q9Y296 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms