Protein–RNA interactions for Protein: Q9XRX5

HHLA3, HERV-H LTR-associating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA3Q9XRX5 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HHLA3Q9XRX5 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms