Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms