Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM44

HHLA2, HERV-H LTR-associating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA2Q9UM44 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HHLA2Q9UM44 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms