Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
BRPF3Q9ULD4 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms