Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PACSIN3Q9UKS6 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms