Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJD2Q9UKL4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GJD2Q9UKL4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GJD2Q9UKL4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GJD2Q9UKL4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GJD2Q9UKL4 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
GJD2Q9UKL4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GJD2Q9UKL4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GJD2Q9UKL4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GJD2Q9UKL4 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GJD2Q9UKL4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GJD2Q9UKL4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GJD2Q9UKL4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GJD2Q9UKL4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJD2Q9UKL4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJD2Q9UKL4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GJD2Q9UKL4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJD2Q9UKL4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJD2Q9UKL4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJD2Q9UKL4 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJD2Q9UKL4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJD2Q9UKL4 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJD2Q9UKL4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GJD2Q9UKL4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJD2Q9UKL4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJD2Q9UKL4 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GJD2Q9UKL4 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJD2Q9UKL4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJD2Q9UKL4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJD2Q9UKL4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJD2Q9UKL4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJD2Q9UKL4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJD2Q9UKL4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJD2Q9UKL4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJD2Q9UKL4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJD2Q9UKL4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJD2Q9UKL4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJD2Q9UKL4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJD2Q9UKL4 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJD2Q9UKL4 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GJD2Q9UKL4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GJD2Q9UKL4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJD2Q9UKL4 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJD2Q9UKL4 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJD2Q9UKL4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GJD2Q9UKL4 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJD2Q9UKL4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GJD2Q9UKL4 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJD2Q9UKL4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJD2Q9UKL4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJD2Q9UKL4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJD2Q9UKL4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJD2Q9UKL4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJD2Q9UKL4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJD2Q9UKL4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GJD2Q9UKL4 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms