Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CASP8AP2Q9UKL3 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP8AP2Q9UKL3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms