Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBE1Q9UJT0 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms