Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IFT172Q9UG01 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms