Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms