Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL9Q9P2J3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL9Q9P2J3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms