Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms