Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SH3BP4Q9P0V3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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SH3BP4Q9P0V3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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SH3BP4Q9P0V3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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SH3BP4Q9P0V3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SH3BP4Q9P0V3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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