Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR2

LRP1B, Low-density lipoprotein receptor-related protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 4,599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1BQ9NZR2 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LRP1BQ9NZR2 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms