Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GDE1Q9NZC3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
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