Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALKBH4Q9NXW9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ALKBH4Q9NXW9 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALKBH4Q9NXW9 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALKBH4Q9NXW9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALKBH4Q9NXW9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALKBH4Q9NXW9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALKBH4Q9NXW9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALKBH4Q9NXW9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALKBH4Q9NXW9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALKBH4Q9NXW9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALKBH4Q9NXW9 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALKBH4Q9NXW9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALKBH4Q9NXW9 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALKBH4Q9NXW9 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALKBH4Q9NXW9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALKBH4Q9NXW9 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALKBH4Q9NXW9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALKBH4Q9NXW9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ALKBH4Q9NXW9 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
ALKBH4Q9NXW9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ALKBH4Q9NXW9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALKBH4Q9NXW9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms