Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CHCHD3Q9NX63 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHCHD3Q9NX63 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms