Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RHBDL2Q9NX52 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms