Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATG3Q9NT62 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATG3Q9NT62 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms