Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PNPLA3Q9NST1 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms