Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUOX1Q9NRD9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUOX1Q9NRD9 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms