Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PFDN4Q9NQP4 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms