Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CASS4Q9NQ75 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms