Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms