Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BRMS1Q9HCU9 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BRMS1Q9HCU9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRMS1Q9HCU9 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRMS1Q9HCU9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRMS1Q9HCU9 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRMS1Q9HCU9 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRMS1Q9HCU9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BRMS1Q9HCU9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRMS1Q9HCU9 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BRMS1Q9HCU9 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRMS1Q9HCU9 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRMS1Q9HCU9 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRMS1Q9HCU9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRMS1Q9HCU9 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRMS1Q9HCU9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRMS1Q9HCU9 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRMS1Q9HCU9 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms