Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC90BQ9GZT6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC90BQ9GZT6 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms