Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H9

SRCIN1, SRC kinase signaling inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCIN1Q9C0H9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRCIN1Q9C0H9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRCIN1Q9C0H9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRCIN1Q9C0H9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRCIN1Q9C0H9 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SRCIN1Q9C0H9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SRCIN1Q9C0H9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRCIN1Q9C0H9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRCIN1Q9C0H9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRCIN1Q9C0H9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRCIN1Q9C0H9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRCIN1Q9C0H9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRCIN1Q9C0H9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRCIN1Q9C0H9 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRCIN1Q9C0H9 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRCIN1Q9C0H9 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRCIN1Q9C0H9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRCIN1Q9C0H9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SRCIN1Q9C0H9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRCIN1Q9C0H9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SRCIN1Q9C0H9 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SRCIN1Q9C0H9 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRCIN1Q9C0H9 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRCIN1Q9C0H9 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SRCIN1Q9C0H9 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRCIN1Q9C0H9 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRCIN1Q9C0H9 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRCIN1Q9C0H9 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRCIN1Q9C0H9 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRCIN1Q9C0H9 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRCIN1Q9C0H9 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRCIN1Q9C0H9 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRCIN1Q9C0H9 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRCIN1Q9C0H9 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRCIN1Q9C0H9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRCIN1Q9C0H9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRCIN1Q9C0H9 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRCIN1Q9C0H9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRCIN1Q9C0H9 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRCIN1Q9C0H9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRCIN1Q9C0H9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SRCIN1Q9C0H9 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRCIN1Q9C0H9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRCIN1Q9C0H9 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRCIN1Q9C0H9 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRCIN1Q9C0H9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRCIN1Q9C0H9 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRCIN1Q9C0H9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRCIN1Q9C0H9 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRCIN1Q9C0H9 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRCIN1Q9C0H9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRCIN1Q9C0H9 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SRCIN1Q9C0H9 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRCIN1Q9C0H9 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SRCIN1Q9C0H9 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRCIN1Q9C0H9 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRCIN1Q9C0H9 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRCIN1Q9C0H9 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRCIN1Q9C0H9 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRCIN1Q9C0H9 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRCIN1Q9C0H9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRCIN1Q9C0H9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRCIN1Q9C0H9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRCIN1Q9C0H9 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRCIN1Q9C0H9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRCIN1Q9C0H9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SRCIN1Q9C0H9 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRCIN1Q9C0H9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SRCIN1Q9C0H9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRCIN1Q9C0H9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRCIN1Q9C0H9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRCIN1Q9C0H9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRCIN1Q9C0H9 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRCIN1Q9C0H9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRCIN1Q9C0H9 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRCIN1Q9C0H9 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRCIN1Q9C0H9 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SRCIN1Q9C0H9 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRCIN1Q9C0H9 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRCIN1Q9C0H9 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRCIN1Q9C0H9 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRCIN1Q9C0H9 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRCIN1Q9C0H9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SRCIN1Q9C0H9 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRCIN1Q9C0H9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRCIN1Q9C0H9 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRCIN1Q9C0H9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRCIN1Q9C0H9 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRCIN1Q9C0H9 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRCIN1Q9C0H9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRCIN1Q9C0H9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRCIN1Q9C0H9 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRCIN1Q9C0H9 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRCIN1Q9C0H9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRCIN1Q9C0H9 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRCIN1Q9C0H9 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRCIN1Q9C0H9 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRCIN1Q9C0H9 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRCIN1Q9C0H9 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRCIN1Q9C0H9 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms