Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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