Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIM8Q9BZR9 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms