Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM3Q9BZL3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms