Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRNKL1Q9BZJ0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
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