Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GSDMCQ9BYG8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms