Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB11FIP5Q9BXF6 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms