Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW4

SSBP3, Single-stranded DNA-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3Q9BWW4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP3Q9BWW4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms