Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
HIGD2AQ9BW72 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms